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IMGT Education

IMGT teaching resources for immunology and immunogenetics

Editors: Marie-Paule Lefranc and Gérard Lefranc (Université Montpellier II, CNRS, Montpellier, France)

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• Enseignements de Marie-Paule Lefranc et Gérard Lefranc

Tutorials

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IMGT

• IMGT Overview
• Bienvenue sur le site IMGT

Ontology | Ontologie

• IMGT-ONTOLOGY (19 figures)

The immune system | Le système immunitaire

• Immunology (Microbiology and Immunology on-line, Richard Hunt, University of South Carolina)
• The immune sytem: overview, glosssary
• Understanding the Immune System. How It Works, NIH Publication No. 03-5423 September 2003

IMGT Colliers de perles

• IMGT Colliers de Perles (IMGT Index)
• IMGT/Collier-de-Perles, a tool to make your own IMGT Collier de Perles
• V-DOMAIN et V-LIKE-DOMAIN: Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003) PMID: 12477501 with permission from Elsevier
• C-DOMAIN et C-LIKE-DOMAIN: Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 185-203 (2005) PMID: 15572068 with permission from Elsevier
• G-DOMAIN and G-LIKE-DOMAIN: Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 917-938 (2005) PMID: 15936075 with permission from Elsevier
• Review on IMGT Colliers de Perles: Kaas Q. and Lefranc M.-P., Current Bioinformatics, 2, 21-30 (2007).

3D structure | Structure 3D

• IMGT Colliers de Perles
• IMGT/3Dstructure-DB contact analysis (IMGT Aide-mémoire)
• Different levels of structural organization of an immunoglobulin or of a T cell receptor
• Correspondence between labels for IG and TR domains in IMGT/3Dstructure-DB and IMGT/LIGM-DB.
• Strand representation of V-DOMAIN and C-DOMAIN (6 figures)
• 3D backbone representation of V-DOMAIN and C-DOMAIN (figures and Colliers de Perles)
• An introduction to Immunoglobulin structure, David Marcey, 2005
• The OMM Exhibits, The Online Macromolecular Museum Exhibits

Immunoglobulins and B cells | Immunoglobulines et lymphocytes B

• The B cell receptor (1 figure)
• Le récepteur des cellules B (1 figure)
• 3D structure of an IgG immunoglobulin and its organization in domains (8 figures)
• Structure tridimensionnelle d'une immunoglobuline IgG et son organisation en domaines (8 figures)
• Immunoglobulin synthesis (IMGT Index)
• Molecular genetics of immunoglobulins (8 figures)
• Génétique moléculaire des immunoglobulines (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (8 figures)
• Genética Molecular das Imunoglobulinas (M.-P. Lefranc e G. Lefranc, Translation G. Passos) (8 figuras)
• Moleculargenetik des Imunoglobulinas (8 abbildungen)
• Régulation de la transcription des gènes des immunoglobulines (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (7 figures)
• Différenciation des lymphocytes B (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (8 figures)
• Activation des lymphocytes B (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (1 figure)
• Transcription factors regulating B cell maturation and activation (IMGT Lexique)
• Structural and biological properties of human immunoglobulins (M.-P. Lefranc and G. Lefranc)
• Human immunoglobulin chain characteristics (M.-P. Lefranc and G. Lefranc)
• Immunoglobulines (ou Anticorps) - Généralités (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Propriétés structurales et biologiques des immunoglobulines sécrétées (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (1 figure)
• Recombination signal sequence logos (Y. Wu and M.-P. Lefranc)
• Somatic hypermutations (M.-P. Lefranc and G. Lefranc)
• IG chains and V-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003) PMID: 12477501 with permission from Elsevier
• IG chains and C-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor constant domains and Ig superfamily C-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 185-203 (2005) PMID: 15572068 with permission from Elsevier

T cell receptors and T cells | Récepteurs T et lymphocytes T

• Différenciation des lymphocytes T (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Activation et mode d'activation des lymphocytes T γ9δ2 humains par les phosphoantigènes (E. Espinosa) (45 diapositives)
• Recombination signal sequence logos (Y. Wu and M.-P. Lefranc)
• TR chains and V-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003) PMID: 12477501 with permission from Elsevier
• TR chains and C-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor constant domains and Ig superfamily C-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 185-203 (2005) PMID: 15572068 with permission from Elsevier

Major histocompatibility complex | Complexe majeur d'histocompatibilité

• Présentation globale du complexe majeur d'histocompatibilité (MHC) (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Protéines du complexe majeur d'histocompatibilité (MHC) (E. Duprat, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Polymorphisme HLA et maladie autoimmunes (J.-F. Eliaou)
• 'History of MHC-HLA' references (including some early reviews and citation classics) M.Tevfik Dorak
• MHC chain and G-DOMAIN. IMGT unique numbering for MHC groove G-DOMAIN and MHC superfamily (MhcSF) G-LIKE-DOMAIN. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 917-938 (2005) PMID: 15936075 with permission from Elsevier
• Comparaison des différences entre les CMH des mammifères et ceux des Eutelostei (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Antigen processing and presentation | Apprêtage des antigènes et présentation

• Antigen processing and presentation (KEGG)
• Degradation and transport of antigens that bind major histocompatibility complex (MHC) class I proteins (Animation)
• Degradation and transport of antigens that bind major histocompatibility complex (MHC) class II proteins (Animation)
• From the test tube to the World Wide Web. The cleavage specificity of the proteasome (Dissertation universität Tübingen, 2001) (A.K. Nussbaum)
• Présentation des antigènes par MHC-Ia à la surface d'une cellule saine (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Présentation des antigènes par MHC-Ia à la surface d'une cellule cancéreuse (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Présentation des antigènes par MHC-Ia à la surface d'une cellule infectée par une bactérie pathogène (ex : Listeria monocytogenes) (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Présentation des antigènes par MHC-Ia à la surface d'une cellule infectée par un virus à ADN (ex : Adenoviridae) (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Présentation des antigènes par MHC-Ia à la surface d'une cellule infectée par un virus à ARN (ex : VIH) (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• Présentation des antigènes par MHC-IIa à la surface d'une cellule saine (E. Gemrot, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Antigen recognition - Allogenic response | Reconnaissance des antigènes - Réponse allogénique

• Histoire de la transplantation d'organes
• Reconnaissance des antigènes (J-F Eliaou) (32 diapositives)
• Réponse allogénique (J.-F. Eliaou) (11 diapositives)

NK receptors | Récepteurs des cellules NK

• Nomenclature of the Leucocyte Receptor Complex (LRC) genes: LILR/ILT and KIR (19q13.42)
• Récepteurs des cellules NK ayant des domaines Ig-like : KIR (19q13.42) (1 figure)
• Récepteurs des cellules NK ayant un domaine de type lectine : récepteurs NKG (12p13.2) (1 figure)

Toll-like receptors | Récepteurs Toll-like

• Toll-like receptors and their ligands

Immunoglobulin superfamily | Superfamille des immunoglobulines

• La superfamille des immunoglobulines (IgSF) (E. Duprat, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• IgSF chains and V-LIKE-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003) PMID: 12477501 with permission from Elsevier
• IgSF chains and C-LIKE-DOMAIN. IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor constant domains and Ig superfamily C-like domains. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 185-203 (2005) PMID: 15572068 with permission from Elsevier

Major histocompatibility complex superfamily | Superfamille du complexe majeur d'histocompatibilité

• La superfamille du complexe majeur d'histocompatibilité (MhcSF) (E. Duprat, M.-P. Lefranc et G. Lefranc)
• MhcSF chains and G-LIKE-DOMAIN. IMGT unique numbering for MHC groove G-DOMAIN and MHC superfamily (MhcSF) G-LIKE-DOMAIN. Lefranc, M.-P. et al., Dev. Comp. Immunol., 29, 917-938 (2005) PMID: 15936075 with permission from Elsevier

Pathology of the immune system | Pathologies du système immunitaire

• Molecular defects in Immunoglobulin Heavy Chain Diseases (HCDs) (M.-P. Lefranc and G. Lefranc) (1 figure)
• Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc) (11 figures)
• Immunité normale et pathologique (M.-P. Lefranc) (35 diapositives)
• Déficits immunitaires congénitaux (M.-P. Lefranc) (50 diapositives)

Cancer, leukemia, lymphoma | Cancer, leucémie, lymphome

• ERIC recommendations on IGHV gene mutational status analysis in chronic lymphocytic leukemia, Leukemia 21, 1-3 (2007).
• Immunoglobulin Gene Analysis in Chronic Lymphocytic Leukemia, Educational Workshop, Uppsala, Sweden, 14-15 june (2007) (slide presentations, tutorials, example sequences).
• Protooncogènes - Oncogènes - Gènes suppresseurs de tumeurs (24 figures)
• Translocations chromosomiques et cancer (G. Guasch) (7 figures)
• Dérégulation moléculaire et cancer : prolifération, survie et inhibition de l'apoptose (G. Guasch) (5 figures)
• Les récepteurs à activité tyrosine kinase (RTKs) réarrangés dans les hémopathies malignes (G. Guasch) (10 figures et 4 tableaux)

Aids and type-1 immunodeficiency virus (HIV-1) | Sida et virus de l'immunodéficience de type-1 (VIH-1)

• Les mécanismes de l'activation de la transcription du virus de l'immunodéficience humaine de type-1 (VIH-1) par Tat (V. Bres) (4 légendes et 3 figures)

Transcription

• Les mécanismes généraux de la transcription par l'ARN polymérase II (V. Bres) (10 légendes et 4 figures)

Epigenetics | Epigénétique

• Modifications épigénétiques et pathologies humaines (T. Forné)
• Les Anticorps: un outil pour la biologie moléculaire (O. Aït Ahmed)

Adhesion molecules | Molécules d'adhésion

• Adhesion molecules (Y. Wu and M.-P. Lefranc)

Integrins | Intégrines

• Diversity of integrins (Y. Wu and M.-P. Lefranc)
• Table of integrins (Y. Wu and M.-P. Lefranc)

Molecular biology of the cell | Biologie moléculaire de la cellule

• Molecular Biology of the Cell, 4th edition on line (B. Alberts et al., published by Garland Science)

RNA interference | ARN interférents

• Une nouvelle classe d'ARN : les petits ARN interférents (F. Ibarrondo ; Illustration et mise en ligne : G. Camus)
• RNA interference. Animation from Nature reviews, RNAi focus

Phage display

• Présentation à la surface de phages filamenteux : les multiples applications du phage display (M.-P. Lefranc et al.) (6 figures et 1 tableau)

Immunological methods | Techniques immunologiques

• Principes des techniques immunologiques d'application courante en analyse médicale
• Preparation of hybridomas

Molecular biophysics and biochemistry | Biophysique et biochimie moléculaires

• Tutorial on tissue optics (Venugopalan V, 2004)
• Electrostatics, Hydrophobicity & Simulation Analysis (M. Gerstein, 1998)

Vaccins

• Découvrir et faire découvrir la vaccinologie aux grands et aux petits

Questions and answers

• Immunoglobulins |  T cell receptors |  Major histocompatibility complex |  Bioinformatics Immunoinformatics
• Immunoglobulines |  Récepteurs T |  Complexe majeur d'histocompatibilité |  Bioinformatique Immunoinformatique

Immunoglobulins | Immunoglobulines

• Nomenclature and overview of the human immunoglobulin genes
• Gènes et locus
• Domaines et Colliers de Perles: structure 3D des anticorps
• Etude des jonctions V-J et V-D-J
• V-J and V-D-J junctions analysis
• Etude des V-LIKE-DOMAINs
• Charte scientifique et IMGT-ONTOLOGY
• Que faut-il savoir ?

T cell receptors | Récepteurs T

• Nomenclature and overview of the human T cell receptor genes
• Gènes et locus
• The T cell receptor constant domains
• Lymphocytes mémoires

Major histocompatibility complex | Complexe majeur d'histocompatibilité

• Position et orientation des gènes HLA-DR dans le locus MHC

Bioinformatics Immunoinformatics | Bioinformatique Immunoinformatique

• IMGT®, système d'information spécialisé en immunogénétique
• IMGT/LIGM-DB - IMGT Gene tables - Fichier à plat - Utilisation d'outils en ligne: IMGT/V-QUEST et IMGT/JunctionAnalysis
• Numérotation unique IMGT
• Module Bioinformatique-Immunoinformatique
• Modulo Bioinformatica (in italian), bases for students in biotechnology - Eugenia Polverini
• From gene to protein analysis

Created: 13/06/2001
Last updated: Monday, 23-Apr-2012 22:01:56 CEST
Editors: Elodie Foulquier, Céline Protat and Chantal Ginestoux
Contact: Marie-Paule Lefranc

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For any other use please contact Marie-Paule Lefranc Marie-Paule.Lefranc@igh.cnrs.fr.

     

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Bioinformatics manager: Véronique Giudicelli Veronique.Giudicelli@igh.cnrs.fr
Computer manager: Patrice Duroux Patrice.Duroux@igh.cnrs.fr
Webmaster: Chantal Ginestoux Chantal.Ginestoux@igh.cnrs.fr

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