IMGT Education

Année Universitaire 2011-2012

Master BIOTIN (inscriptions)

Dossier de candidature (.doc) (.docx)
A remettre impérativement et complet avant le 18 juin 2011

Année Universitaire 2010-2011

Maison des Ecoles Doctorales de Montpellier (2010-2011)

Module "Bioinformatique et Ontologies" (2010-2011)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• Bioinformatique et ontologies , 17 mai 2011 (Marie-Paule Lefranc)
• Ontologies Langage OWL - Application à la formalisation des concepts de description d'IMGT-ONTOLOGY avec l'éditeur Protégé , 18 mai 2011 (Véronique Giudicelli)
• Mise en place d'une démarche qualité dans un système d'information , 19 mai 2011 (Laëtitia Regnier)
• Ontologies et Système d'information, 19 mai 2011 (Patrice Duroux)

Master M1 Biologie-Santé, Université Montpellier 1 et Université Montpellier 2 (2010-2011)

Immunopathologie (FMBS215)
Responsables : Pr. Jacques Clot (Université Montpellier 1), Dr. Jean-Luc Aymeric (Université Montpellier 2)

• Déficits immunitaires - Immunogénétique normale et pathologique - Cours 1 , février 2011 et 31 mars 2011 (Gérard Lefranc et Marie-Paule Lefranc)
• Déficits immunitaires - Immunogénétique normale et pathologique - Cours 2 , février 2011 et 31 mars 2011 (Gérard Lefranc et Marie-Paule Lefranc)
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Bases moléculaires et métaboliques des maladies héréditaires (FMBS107)
Responsables : Dr. Pascale Perrin (Université Montpellier 2), Pr. Mireille Claustres, Dr. Christophe Béroud (Université Montpellier 1)

• Déficits immunitaires d'origine génétique, 5 octobre 2010 (Marie-Paule Lefranc)
  
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Master M2 - Intégration des Compétences - Bioinformatique, Université Montpellier 2 (2010-2011)

FMBS 326 - Immunoinformatique - Analyse de génomes
13-17 décembre 2010
Responsable : Marie-Paule Lefranc
Intervenants : Marie-Paule Lefranc, Géraldine Folch, Joumana Jabado-Michaloud, Jérôme Lane

• Introduction : analyse de génomes en immunogénétique, Travaux pratiques

FMBS 327 - Structure
10 octobre - 18 décembre 2010
Responsables : Stefano Trapani, Marie-Paule Lefranc
Intervenants : Stefano Trapani, François Ehrenmann

• Les immunoglobulines dans IMGT/3Dstructure-DB, 3 novembre 2010 (François Ehrenmann)

Master 2 recherche Bio-Med, Universités Montpellier 1 et 2, ENSCM (2010-2011)

FMBS312 - UE Bioinformatique
Responsables : Marie-Paule Lefranc et Stefano Trapani

• Systèmes d'information - Ontologies - Bases de connaissances, 27 septembre 2010 (Véronique Giudicelli)
• Immunoinformatique, 30 septembre 2010 (Marie-Paule Lefranc)
• Bioinformatique : du gène à la structure, 30 septembre 2010 (Marie-Paule Lefranc)

Année Universitaire 2009-2010

Maison des Ecoles Doctorales de Montpellier (2009-2010)

Module "Bioinformatique et Ontologies" (2009-2010)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• Bioinformatique et ontologies, 4 mai 2010 (Marie-Paule Lefranc)
• Ontologies et l'éditeur Protégé - Application à la formalisation des concepts de description d'IMGT-ONTOLOGY, 5 mai 2010 (Véronique Giudicelli)
• Mise en place d'une démarche qualité dans un système d'information, 6 mai 2010 (Laëtitia Regnier)
• Ontologies et Système d'information, 6 mai 2010 (Patrice Duroux)

Master M2 - Intégration des Compétences - Bioinformatique, Université Montpellier 2 (2009-2010)

FMBS 327 - Structure
8 octobre - 17 décembre 2009
Responsables : Stefano Trapani, Marie-Paule Lefranc
Intervenants : Stefano Trapani, François Ehrenmann

• Les immunoglobulines dans IMGT/3Dstructure-DB, 26 novembre 2009 (François Ehrenmann)

FMBS 326 - Immunoinformatique - Analyse de génomes
4-8 janvier 2010
Responsable : Marie-Paule Lefranc
Intervenants : Marie-Paule Lefranc, Géraldine Folch, Amandine Lacan, Jérôme Lane

• Introduction : analyse de génomes en immunogénétique, 4 janvier 2010 (Marie-Paule Lefranc)

Master 2 recherche Bio-Med, Universités Montpellier 1 et 2, ENSCM (2009-2010)

FMBS312 - UE Bioinformatique
Responsables : Marie-Paule Lefranc et Stefano Trapani

• Systèmes d'information - Ontologies - Bases de connaissances, 27 septembre 2010 (Véronique Giudicelli)
• Immunoinformatique, 30 septembre 2010 (Marie-Paule Lefranc)
• Bioinformatique : du gène à la structure, 30 septembre 2010 (Marie-Paule Lefranc)

Master M1 Biologie-Santé, Université Montpellier 1 et Université Montpellier 2 (2009-2010)

Bases moléculaires et métaboliques des maladies héréditaires (FMBS107)
Responsables : Dr. Pascale Perrin (Université Montpellier 2), Pr. Mireille Claustres, Dr. Christophe Béroud (Université Montpellier 1)

• Déficits immunitaires d'origine génétique 29 septembre 2009 (Marie-Paule Lefranc)
  
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Immunopathologie (FMBS215)
Responsables : Pr. Jacques Clot (Université Montpellier 1), Dr. Jean-Luc Aymeric (Université Montpellier 2)

• Déficits immunitaires congénitaux 25 mars 2010 (Marie-Paule Lefranc)
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Année Universitaire 2008-2009

Maison des Ecoles Doctorales de Montpellier

Module "Bioinformatique et Ontologies" (2008-2009)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• Bioinformatique et ontologies, 12 mai 2009 (Marie-Paule Lefranc)
• Implémentation de concepts de DESCRIPTION de IMGT-ONTOLOGY sous Protégé, 13mai 2009 (Véronique Giudicelli)
• Contrôle qualité et ontologies, 14 mai 2009 (Laëtitia Regnier)
• Ontologies et Système d'information, 14 mai 2009 (Patrice Duroux)

Master 2 recherche Bio-Med, Universités Montpellier 1 et 2, ENSCM (2008-2009)

FMBS312 - UE Bioinformatique
Responsables : Marie-Paule Lefranc et Stefano Trapani

• Systèmes d'information - Ontologies - Bases de connaissances, 29 septembre 2009 (Véronique Giudicelli)
• Immunoinformatique, 1er octobre 2009 (Marie-Paule Lefranc)
• Bioinformatique : du gène à la structure, 1er octobre 2009 (Marie-Paule Lefranc)

Master M1 (2008-2009)

Immunopathologie (UMBS217)
Responsables : Professeur Jacques Clot (Université Montpellier 1) et Professeur Gérard Lefranc (Université Montpellier 2)

• Déficits immunitaires congénitaux
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

FMBS312 - UE Bioinformatique
Responsables : Marie-Paule Lefranc et Stefano Trapani

• Systèmes d'information - Ontologies - Bases de connaissances, 29 septembre 2008 (Véronique Giudicelli)
• Immunoinformatique, 2 octobre 2008 (Marie-Paule Lefranc)
• Bioinformatique : du gène à la structure, 3 octobre 2008 (Marie-Paule Lefranc)

Année Universitaire 2007-2008

Maison des Ecoles Doctorales de Montpellier

Module "Bioinformatique et Ontologies" (2007-2008)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• IMGT-ONTOLOGY axioms et concepts, 20 mai 2008 (Marie-Paule Lefranc)
• Implémentation de concepts de DESCRIPTION de IMGT-ONTOLOGY sous l'éditeur d'ontologies Protégé, 21 mai 2008 (Véronique Giudicelli)
• Contrôle de qualité et ontologies, 22 mai 2008 (Laëtitia Regnier)
• Ontologies et Système d'information, 22 mai 2008 (Patrice Duroux)

Master M1 (2007-2008)

Immunopathologie (UMBS217)
Responsables : Professeur Jacques Clot (Université Montpellier 1) et Professeur Gérard Lefranc (Université Montpellier 2)

• Déficits immunitaires congénitaux
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 27 mars 2008
• Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Master 2 recherche Bio-Med, Universités Montpellier 1 et 2, ENSCM (2007-2008)

TC3 UE Bioinformatique
Responsables: Marie-Paule Lefranc et Marc-André Delsuc)

• Immunoinformatique, 27 septembre 2007 (Marie-Paule Lefranc)
• Bioinformatique: du gène à la structure, 27 septembre 2007 (Marie-Paule Lefranc)

Année Universitaire 2006-2007

Master M1 (2006-2007)

Bases moléculaires des maladies génétiques (UMBS107)
Responsables : Professeur Gérard Lefranc (Université Montpellier 2), Professeur Mireille Claustres, Dr Christophe Béroud (Université Montpellier 1)

• Immunogénétique normale et pathologique
  Cours de Gérard Lefranc, 21 Novembre 2006
  Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Immunopathologie (UMBS217)
Responsables : Professeur Jacques Clot et Professeur Gérard Lefranc

• Déficits immunitaires congénitaux
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 22 mars 2007

M2R Master 2 Recherche Biologie-Santé (2006-2007)
Cliquer sur TC3 pour l'UE Bioinformatique (responsables: Marie-Paule Lefranc and Marc-André Delsuc)

• Bases de connaissances, système d'information et ontologies, 5 octobre 2006 (Véronique Giudicelli)
• Immunoinformatique, 5 Octobre 2006 (Marie-Paule Lefranc)

M2P Master 2 Biotechnologies, Cytologie moléculaire appliquée CMA (2006-2007)

• UE Immunoinformatique - Immunotechnologie (responsable: Marie-Paule Lefranc) (2006-2007)
  • Présentation et accès aux bases de données OMIM, EMBL/GenBank, SWISS-PROT, PDB et au système d'information IMGT (V. Giudicelli)

Master M1 et M2 (2006-2007)

• Parcours Bioinformatique (Mention Biologie-Santé Spécialité Biotechnologies)
• Spécialité Bioinformatique (Mention Biologie-Géosciences-Agroressources-Environnement)

Année Universitaire 2005-2006

Master M1 (2005-2006)

Bases moléculaires des maladies génétiques (UMBS107)
Responsables : Professeur Gérard Lefranc (Université Montpellier 2), Professeur Mireille Claustres, Dr Christophe Béroud (Université Montpellier 1)

• Immunogénétique normale et pathologique
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 15 Novembre 2005
  Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Immunopathologie (UMBS217)
Responsables : Professeur Jacques Clot et Professeur Gérard Lefranc

• Déficits immunitaires congénitaux
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 30 mars 2006

M2R Master 2 Recherche Biologie-Santé (2005-2006)

• UE Bioinformatique (responsables: Marie-Paule Lefranc and Marc-André Delsuc)

M2P Master 2 Biotechnologies, Cytologie moléculaire appliquée CMA (2005-2006)

• UE Immunoinformatique - Immunotechnologie (responsable: Marie-Paule Lefranc) (2005-2006)

Master septembre 2005 à l'Université Montpellier 2

• Pour plus d'information sur le contenu pédagogique du parcours Bioinformatique:
  http://www.info-ufr.univ-montp2.fr/Formations/LMD/Master/master_proBioinfo.html

Année Universitaire 2004-2005

Master M1 (ouvert en septembre 2004)

Bases moléculaires des maladies génétiques (UMBS107)
Responsables : Professeur Mireille Claustres et Professeur Gérard Lefranc

• Immunogénétique normale et pathologique
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 7 décembre 2004
  Voir aussi : Déficits immunitaires primaires : les mécanismes moléculaires (M.-P. Lefranc et G. Lefranc)

Immunopathologie (UMBS217)
Responsables : Professeur Jacques Clot et Professeur Gérard Lefranc

• Déficits immunitaires congénitaux
  Cours de Marie-Paule Lefranc, 15 mars 2005

Master 2 Bioinformatique, Université Montpellier 2 (2008-2009)

UE Analyse de génomes (FMBS326)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• Introduction: analyse de génomes en immunogénétique, 13-16 janvier 2009

Master 2 Bioinformatique, Université Montpellier 2 (2007-2008)

UE Analyse de génomes (FMBS326)
Responsable: Marie-Paule Lefranc

• Introduction: analyse de génomes en immunogénétique, 11 mars 2008

Département d'Enseignement de Biochimie-Biologie, Université Montpellier 2

Portail pédagogique de l'Université Montpellier 2

Département d'Enseignement de Biochimie-Biologie, Université Montpellier 2

DEUG Sciences et Technologie
Mention: Sciences de la Vie - Option concours

• Programme du module 2002-2003 (Biochimie et Immunologie)
• Métabolisme hépatique des glucides (Questions and Answers)
• Principes des techniques immunologiques d'application courante en analyse médicale (Tutorials)
• Les Immunoglobulines (ou Anticorps) (Tutorials)
• Exemples de questions d'examen

Licence de Biochimie

• Immunoglobulines : Que faut-il savoir ? (Questions and Answers)
• IMGT, système d'information spécialisé en immunogénétique (Avril 2003)

Maîtrise de Biochimie

• Immunoglobulines : Que faut-il savoir ? (Questions and Answers)

DESS Cytologie Moléculaire Appliquée
Responsable du module "Immunologie" : M.-P. Lefranc

• Correction du sujet d'examen 2001-2002
• Programme du module 2004-2005

DESS Bioinformatique (créé en Septembre 2001)
Responsables : M.-P. Lefranc and V. Berry

• Module Analyse de génomes
  • 2002 - Soumission d'alignements de séquences de référence IMGT à Webin-Align et Analyse des locus IG et TR dans ENSEMBL
  • 2003 - Analyse du locus IGK humain: Développement d'outils permettant de représenter graphiquement les clones et les gènes qu'il contient.

Portail pédagogique de l'Université Montpellier 2

Master Immunotechnologies et Biothérapies - Module "Anticorps monoclonaux. Parcours Immunotechnologies et Biothérapies"

Plateforme IMGT - Bases de données anticorps http://www.imgt.org, 11 octobre 2010 (Marie-Paule Lefranc)

Module Bioinformatique-Immunoinformatique (créé en Septembre 2002), Ecole Doctorale, Université Saint-Joseph, Beyrouth
Responsable : M.-P. Lefranc (Université Montpellier 2)

• Programme du module 2002
• Examen du module 2002 (Questions and Answers)

2005

Cours de Bioinformatique et d'Analyse des Données Génomiques, organisé par le Centre de Biotechnologie de Sfax, du 23 mars au 02 avril 2005
Cours de M.-P. Lefranc (25 mars 2005) : Ressources Web en Bioinformatique et en génomique : présentation et pratique.
Bioinformatics and Genome Data Analysis course, Organized by A. Rebai, H. Ayadi and F. Tekaia, Sfax, Tunisia (March 23- April 2, 2005)

2004

Quatrième cours de Bioinformatique, CBIS'2004, organisé par l'Université de Sfax pour le Sud, le Centre de Biotechnologie de Sfax, la Faculté de Médecine de Sfax et le Laboratoire de Génétique Moléculaire Humaine, du 31 mai au 12 juin 2004.
Comité d'organisation et formateurs : Prof. Hammadi Ayadi (Faculté de Médecine de Sfax, Directeur du Centre de Biotechnologie de Sfax), Ahmed Rebai (Centre de Biotechnologie de Sfax), Fredj Tekaia (Institut Pasteur de Paris), Sonia Abdelhak (Institut Pasteur de Tunis), Marie-Paule Lefranc (Université Montpellier 2 et CNRS), Hassen Hadj Kacem (Faculté de Médecine de Sfax), Nacim Louhichi (Faculté des Sciences de Sfax), Mohamed R. Aniba (Centre de Biotechnologie de Sfax).
Conférence de M.-P. Lefranc (31 Mai 2004).
"IMGT : Histoire, actualités et perspectives d'un système d'information sur les molécules de l'immunité"

Cours pratique de M.-P. Lefranc (1er juin 2004) : IMGT, the international ImMunoGeneTics information system®, http://www.imgt.org, pour les immunoglobulines, récepteurs T et CMH.

• Les bases de données IMGT de séquences (IMGT/LIGM-DB) et de gènes (IMGT/GENE-DB)
• Les ressources Web : IMGT Repertoire et IMGT Scientific chart
• Les outils d'analyse de séquences et de gènes : IMGT/V-QUEST et IMGT/JunctionAnalysis
• La base de données IMGT de structures 3D (IMGT/3Dstructure-DB).

2003

Troisième cours de Bioinformatique, organisé par l'Université de Sfax pour le Sud et la Faculté de Médecine de Sfax
organisé par l'Université de Sfax pour le Sud et la Faculté de Médecine de Sfax
CBIS'2003, du 26 au 31 mai 2003
Responsable : Prof. Hammadi Ayadi
Animateurs : Rebai Ahmed, Tekaia Fredj (Institut Pasteur, Pairs), Hadj Kacem Hasse, Louhichi Nacim

Intervention de M.-P. Lefranc (30 Mai, 14h-18h)
IMGT, the international ImMunoGeneTics information system®, http://www.imgt.org, pour les immunoglobulines, récepteurs T et CMH.

1. Les ressources Web : IMGT Repertoire et IMGT Scientific chart
2. Les outils d'analyse de séquences et de gènes : IMGT/V-QUEST et IMGT/JunctionAnalysis
3. Les bases de données
   • de séquences : IMGT/LIGM-DB
   • de gènes : IMGT/GENE-DB
   • de structure 3D : IMGT/3Dstructure-DB