Alignment of alleles: Sandbar shark (Carcharhinus plumbeus) IGHD (overview)

Only one sequence for each allele is shown. This set of sequences is part of the IMGT reference directory.
Other known sequences are shown in the individual  Alignments of alleles.

                     Direct 5'- 3' orientation                                   Inverted orientation
 U40560  ,IGHD1*01 #c
 I  Y  T  G  A  L  A  W  V 
  S  I  Q  G  L  W  L  G  
   L  Y  R  G  S  G  L  G 
ATCTATACAGGGGCTCTGGCTTGGGTA 
 Y  P  S  Q  S  P  C  I  D 
  T  Q  A  R  A  P  V  *  
   P  K  P  E  P  L  Y  R 
TACCCAAGCCAGAGCCCCTGTATAGAT 
 U50605  ,IGHD2*01 #c
 T  I  T  G  E  L  Y  L  V  S  E  E  T  V  V  A  S  P 
  P  L  Q  G  S  Y  I  W  C  P  K  K  P  L  S  L  A  
   H  Y  R  G  V  I  F  G  V  R  R  N  R  C  R  *  P 
ACCATTACAGGGGAGTTATATTTGGTGTCCGAAGAAACCGTTGTCGCTAGCCCT 
 R  A  S  D  N  G  F  F  G  H  Q  I  *  L  P  C  N  G 
  G  L  A  T  T  V  S  S  D  T  K  Y  N  S  P  V  M  
   G  *  R  Q  R  F  L  R  T  P  N  I  T  P  L  *  W 
AGGGCTAGCGACAACGGTTTCTTCGGACACCAAATATAACTCCCCTGTAATGGT
 U50604  ,IGHD3*01 #c
 G  E  Y  E  Y  S  T  P 
  G  N  T  S  T  L  R  
   G  I  R  V  L  Y  A 
GGGGAATACGAGTACTCTACGCCT 
 R  R  R  V  L  V  F  P 
  G  V  E  Y  S  Y  S  
   A  *  S  T  R  I  P 
AGGCGTAGAGTACTCGTATTCCCC
 U50607  ,IGHD4*01 #c
 P  L  Q  A  P  Y  W  L  D 
  L  Y  R  H  H  T  G  W  
   S  T  G  T  I  L  V  G 
CCTCTACAGGCACCATACTGGTTGGAC 
 V  Q  P  V  W  C  L  *  R 
  S  N  Q  Y  G  A  C  R  
   P  T  S  M  V  P  V  E 
GTCCAACCAGTATGGTGCCTGTAGAGG
 U50606  ,IGHD5*01 #c
 I  L  G  A  P  I  Y  L 
  S  L  G  R  L  Y  I  
   P  W  G  A  Y  I  F 
ATCCTTGGGGCGCCTATATATTTA 
 *  I  Y  R  R  P  K  D 
  K  Y  I  G  A  P  R  
   N  I  *  A  P  Q  G 
TAAATATATAGGCGCCCCAAGGAT
 U50608  ,IGHD6*01 #c
 N  Q  E  G  S  H  W  L  R 
  T  K  R  G  H  T  G  Y  
   P  R  G  V  T  L  A  T 
AACCAAGAGGGGTCACACTGGCTACGT
 T  *  P  V  *  P  L  L  V 
  R  S  Q  C  D  P  S  W  
   V  A  S  V  T  P  L  G 
ACGTAGCCAGTGTGACCCCTCTTGGTT
 U50609  ,IGHD7*01 #c
 I  Y  T  G  A  L  V  L  G 
  S  I  Q  G  L  W  S  W  
   L  Y  R  G  S  G  L  G 
ATCTATACAGGGGCTCTGGTCTTGGGT
 T  Q  D  Q  S  P  C  I  D 
  P  K  T  R  A  P  V  *  
   P  R  P  E  P  L  Y  R 
ACCCAAGACCAGAGCCCCTGTATAGAT
 U50610  ,IGHD8*01 #c
 I  Y  T  G  E  L  A  W  V 
  S  I  Q  G  N  W  L  G  
   L  Y  R  G  T  G  L  G 
ATCTATACAGGGGAACTGGCTTGGGTA
 Y  P  S  Q  F  P  C  I  D 
  T  Q  A  S  S  P  V  *  
   P  K  P  V  P  L  Y  R 
TACCCAAGCCAGTTCCCCTGTATAGAT
#c: rearranged cDNA


Created: Tuesday, 03-Apr-2012 08:20:21 CEST
Author: Dominique Scaviner

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