IMGT Web resources: IMGT repertoire Alignment of alleles: Human IGHD (overview)

Print of this table: Ruiz, M. et al., Exp. Clin. Immunogenet., 16, 173-184 (1999). PMID:10394055

When several alleles are shown, the nucleotide mutations are indicated in red letters. These polymorphic mutations are reported in Tables of alleles.
Dashes indicate identical nucleotides. Dots indicate gaps by comparison to the longest sequence. Blanks indicate partial sequences (blanks at the 5' and/or 3' end).

Only one sequence for each allele is shown. This set of sequences is part of the IMGT reference directory.
Other known sequences are shown in the individual  Alignements of alleles

                                                          Direct 5'- 3' orientation                                             Inverted orientation
   X97051  ,IGHD1-1*01  
 

 G T T G T
  V Q L E R
   Y N W N D
GGTACAACTGGAACGAC    

 V V P V V
  S F Q L Y
   R S S C T
GTCGTTCCAGTTGTACC
   X13972  ,IGHD1-7*01  
 

 G I T G T
  V * L E L
   Y N W N Y
GGTATAACTGGAACTAC    

 V V P V I
  * F Q L Y
   S S S Y T
GTAGTTCCAGTTATACC
   X13972  ,IGHD1-14*01  
 

 G I T G T
  V * P E P
   Y N R N H
GGTATAACCGGAACCAC    

 V V P V I
  W F R L Y
   G S G Y T
GTGGTTCCGGTTATACC
   X97051  ,IGHD1-20*01  
 

 G I T G T
  V * L E R
   Y N W N D
GGTATAACTGGAACGAC    

 V V P V I
  S F Q L Y
   R S S Y T
GTCGTTCCAGTTATACC
   X97051  ,IGHD1-26*01  
 

 G I V G A T
  V * W E L L
   Y S G S Y Y
GGTATAGTGGGAGCTACTAC    

 V V A P T I
  * * L P L Y
   S S S H Y T
GTAGTAGCTCCCACTATACC
   J00232  ,IGHD2-2*01  
 

 R I L * * Y Q L L C
  G Y C S S T S C Y A
   D I V V V P A A M
AGGATATTGTAGTAGTACCAGCTGCTATGCC    

 G I A A G T T T I S
  A * Q L V L L Q Y P
   H S S W Y Y Y N I
GGCATAGCAGCTGGTACTACTACAATATCCT
   X97051  ,IGHD2-2*02  
 

 R I L * * Y Q L L Y
  G Y C S S T S C Y T
   D I V V V P A A I
AGGATATTGTAGTAGTACCAGCTGCTATACC    

 G I A A G T T T I S
  V * Q L V L L Q Y P
   Y S S W Y Y Y N I
GGTATAGCAGCTGGTACTACTACAATATCCT
   M35648  ,IGHD2-2*03  
 

 W I L * * Y Q L L C
  G Y C S S T S C Y A
   D I V V V P A A M
TGGATATTGTAGTAGTACCAGCTGCTATGCC    

 G I A A G T T T I S
  A * Q L V L L Q Y P
   H S S W Y Y Y N I
GGCATAGCAGCTGGTACTACTACAATATCCA
   X13972  ,IGHD2-8*01  
 

 R I L Y * W C M L Y
  G Y C T N G V C Y T
   D I V L M V Y A I
AGGATATTGTACTAATGGTGTATGCTATACC    

 G I A Y T I S T I S
  V * H T P L V Q Y P
   Y S I H H * Y N I
GGTATAGCATACACCATTAGTACAATATCCT
   J00233  ,IGHD2-8*02  
 

 R I L Y W W C M L Y
  G Y C T G G V C Y T
   D I V L V V Y A I
AGGATATTGTACTGGTGGTGTATGCTATACC    

 G I A Y T T S T I S
  V * H T P P V Q Y P
   Y S I H H Q Y N I
GGTATAGCATACACCACCAGTACAATATCCT
   J00234  ,IGHD2-15*01  
 

 R I L * W W * L L L
  G Y C S G G S C Y S
   D I V V V V A A T
AGGATATTGTAGTGGTGGTAGCTGCTACTCC    

 G V A A T T T T I S
  E * Q L P P L Q Y P
   S S S Y H H Y N I
GGAGTAGCAGCTACCACCACTACAATATCCT
   J00235  ,IGHD2-21*01  
 

 S I L W W * L L F
  A Y C G G D C Y S
   H I V V V I A I
AGCATATTGTGGTGGTGATTGCTATTCC    

 G I A I T T T I C
  E * Q S P P Q Y A
   N S N H H H N M
GGAATAGCAATCACCACCACAATATGCT
   X97051  ,IGHD2-21*02  
 

 S I L W W * L L F
  A Y C G G D C Y S
   H I V V V T A I
AGCATATTGTGGTGGTGACTGCTATTCC    

 G I A V T T T I C
  E * Q S P P Q Y A
   N S S H H H N M
GGAATAGCAGTCACCACCACAATATGCT
   X13972  ,IGHD3-3*01  
 

 V L R F L E W L L Y
  Y Y D F W S G Y Y T
   I T I F G V V I I
GTATTACGATTTTTGGAGTGGTTATTATACC    

 G I I T T P K I V I
  V * * P L Q K S * Y
   Y N N H S K N R N
GGTATAATAACCACTCCAAAAATCGTAATAC
   X93618  ,IGHD3-3*02  
 

 V L A F L E W L L Y
  Y * H F W S G Y Y T
   I S I F G V V I I
GTATTAGCATTTTTGGAGTGGTTATTATACC    

 G I I T T P K M L I
  V * * P L Q K C * Y
   Y N N H S K N A N
GGTATAATAACCACTCCAAAAATGCTAATAC
   X13972  ,IGHD3-9*01  
 

 V L R Y F D W L L *
  Y Y D I L T G Y Y N
   I T I F * L V I I
GTATTACGATATTTTGACTGGTTATTATAAC    

 V I I T S Q N I V I
  L * * P V K I S * Y
   Y N N Q S K Y R N
GTTATAATAACCAGTCAAAATATCGTAATAC
   X13972  ,IGHD3-10*01  
 

 V L L W F G E L L *
  Y Y Y G S G S Y Y N
   I T M V R G V I I
GTATTACTATGGTTCGGGGAGTTATTATAAC    

 V I I T P R T I V I
  L * * L P E P * * Y
   Y N N S P N H S N
GTTATAATAACTCCCCGAACCATAGTAATAC
   X93615  ,IGHD3-10*02  
 

 V L L C S G S Y Y N
  Y Y Y V R G V I I
   I T M F G E L L *
GTATTACTATG.TTCGGGGAGTTATTATAAC    

 V I I T P R T * * Y
  L * * L P E H S N
   Y N N S P N I V I
GTTATAATAACTCCCCGAAC.ATAGTAATAC
   X93614  ,IGHD3-16*01  
 

 V L * L R L G E L C L Y
  Y Y D Y V W G S Y A Y T
   I M I T F G G V M L I
GTATTATGATTACGTTTGGGGGAGTTATGCTTATACC    

 G I S I T P P N V I I I
  V * A * L P Q T * S * Y
   Y K H N S P K R N H N
GGTATAAGCATAACTCCCCCAAACGTAATCATAATAC
   X97051  ,IGHD3-16*02  
 

 V L * L R L G E L S L Y
  Y Y D Y V W G S Y R Y T
   I M I T F G G V I V I
GTATTATGATTACGTTTGGGGGAGTTATCGTTATACC    

 G I T I T P P N V I I I
  V * R * L P Q T * S * Y
   Y N D N S P K R N H N
GGTATAACGATAACTCCCCCAAACGTAATCATAATAC
   X93616  ,IGHD3-22*01  
 

 V L L * * * W L L L
  Y Y Y D S S G Y Y Y
   I T M I V V V I T
GTATTACTATGATAGTAGTGGTTATTACTAC    

 V V I T T T I I V I
  * * * P L L S * * Y
   S N N H Y Y H S N
GTAGTAATAACCACTACTATCATAGTAATAC
   X13972  ,IGHD4-4*01 (1) 
 

 * L Q * L
  D Y S N Y
   T T V T
TGACTACAGTAACTAC    

 V V T V V
  * L L * S
   S Y C S
GTAGTTACTGTAGTCA
   X13972  ,IGHD4-11*01 (1) 
 

 * L Q * L
  D Y S N Y
   T T V T
TGACTACAGTAACTAC    

 V V T V V
  * L L * S
   S Y C S
GTAGTTACTGTAGTCA
   X97051  ,IGHD4-17*01  
 

 * L R * L
  D Y G D Y
   T T V T
TGACTACGGTGACTAC    

 V V T V V
  * S P * S
   S H R S
GTAGTCACCGTAGTCA
   X97051  ,IGHD4-23*01  
 

 * L R W * L
  D Y G G N S
   T T V V T
TGACTACGGTGGTAACTCC    

 G V T T V V
  E L P P * S
   S Y H R S
GGAGTTACCACCGTAGTCA
   X13972  ,IGHD5-5*01 (2) 
 

 V D T A M V
  W I Q L W L
   G Y S Y G Y
GTGGATACAGCTATGGTTAC    

 V T I A V S
  * P * L Y P
   N H S C I H
GTAACCATAGCTGTATCCAC
   X13972  ,IGHD5-12*01  
 

 V D I V A T I
  W I * W L R L
   G Y S G Y D Y
GTGGATATAGTGGCTACGATTAC    

 V I V A T I S
  * S * P L Y P
   N R S H Y I H
GTAATCGTAGCCACTATATCCAC
   X97051  ,IGHD5-18*01 (2) 
 

 V D T A M V
  W I Q L W L
   G Y S Y G Y
GTGGATACAGCTATGGTTAC    

 V T I A V S
  * P * L Y P
   N H S C I H
GTAACCATAGCTGTATCCAC
   X97051  ,IGHD5-24*01  
 

 V E M A T I
  * R W L Q L
   R D G Y N Y
GTAGAGATGGCTACAATTAC    

 V I V A I S
  * L * P S L
   N C S H L Y
GTAATTGTAGCCATCTCTAC
   X13972  ,IGHD6-6*01  
 

 E Y S S S S
  S I A A R
   V * Q L V
GAGTATAGCAGCTCGTCC    

 G R A A I L
  D E L L Y
   T S C Y T
GGACGAGCTGCTATACTC
   X13972  ,IGHD6-13*01  
 

 G Y S S S W Y
  G I A A A G
   V * Q Q L V
GGGTATAGCAGCAGCTGGTAC    

 V P A A A I P
  Y Q L L L Y
   T S C C Y T
GTACCAGCTGCTGCTATACCC
   X97051  ,IGHD6-19*01  
 

 G Y S S G W Y
  G I A V A G
   V * Q W L V
GGGTATAGCAGTGGCTGGTAC    

 V P A T A I P
  Y Q P L L Y
   T S H C Y T
GTACCAGCCACTGCTATACCC
   X97051  ,IGHD6-25*01  
 

 G Y S S G Y
  G I A A A
   V * Q R L
GGGTATAGCAGCGGCTAC    

 V A A A I P
  * P L L Y
   S R C Y T
GTAGCCGCTGCTATACCC
   J00256  ,IGHD7-27*01  
 

 L T G
  * L G
   N W G
CTAACTGGGGA    

 S P V
  P Q L
   P S *
TCCCCAGTTAG

(1) Sequences of the allele *01 of IGHD4-4 and IGHD4-11 are identical.
(2) Sequences of the allele *01 of IGHD5-5 and IGHD5-18 are identical.


This alignement of allele has been generated with the IMGT/AlleleAlign tool developed by Dominique Scaviner (22/02/2002).

Last Updated: Monday, 11-Jul-2011 12:56:55 CEST
Created: 17/10/1997
Authors: Dominique Scaviner, Manuel Ruiz
Contact: Marie-Paule Lefranc

Software material and data coming from IMGT server may be used for academic research only, provided that it is referred to IMGT®, and cited as "IMGT®, the international ImMunoGeneTics information system® http://www.imgt.org (founder and director: Marie-Paule Lefranc, Montpellier, France)." References to cite: Lefranc, M.-P. et al., Nucleic Acids Research, 27, 209-212 (1999) Cover of NAR; Ruiz, M. et al., Nucleic Acids Research, 28, 219-221 (2000); Lefranc, M.-P., Nucleic Acids Research, 29, 207-209 (2001); Lefranc, M.-P., Nucleic Acids Res., 31, 307-310 (2003); Lefranc, M.-P. et al., In Silico Biol., 5, 0006 (2004) [Epub], 5, 45-60 (2005); Lefranc, M.-P. et al., Nucleic Acids Res., 33, D593-D597 (2005) Full text; Lefranc, M.-P. et al., Nucleic Acids Research 2009 37: D1006-D1012; doi:10.1093/nar/gkn838 Full text.


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