IMGT® : UN LANGAGE COMMUN POUR L’IMMUNOGENETIQUE Confrontés
aux antigènes d’une extrême diversité des virus, bactéries, parasites,
ainsi qu’à ceux des cellules tumorales, les vertébrés sont les seuls
organismes capables d’une réponse immunitaire adaptative. Celle-ci est
caractérisée par une reconnaissance spécifique très fine de ces
antigènes, à l’aide de récepteurs eux-mêmes extraordinairement
diversifiés, les immunoglobulines (IG) ou anticorps et les récepteurs
des lymphocytes T (TR). Cette diversité quasi illimitée (1012 par
individu !!) résulte de processus tout à fait originaux. Une telle
complexité de fonctionnement qui « bouscule » les « dogmes » de la génétique « classique », ne pouvait être prise en compte que par des programmes et des outils bioinformatiques très spécifiques. Un système « standard » pour la mise en commun des informations. Pour
établir le lien entre ces événements génétiques originaux et les
protéines qui en résultent, il fallait créer un système d’information
spécialisé en immunogénétique qui permette l’intégration de toutes les
données, un système qui devienne « la » référence. C’est en 1989, à
l’issue du congrès HGM (Human Genome Mapping) de New Haven que le défi
est lancé. Enseignante-chercheur à l’Université de Montpellier depuis
1982, Marie-Paule Lefranc
a consacré l’essentiel de ses recherches à la génétique moléculaire des
anticorps et des récepteurs T. Avec son Equipe, elle s’investit dans ce
sujet difficile et finalise IMGT®, the international ImMunoGeneTics
information system®. « Les bases existantes n’avaient ni notre
spécificité ni notre expérience du domaine, explique-t-elle. Nous
avons énormément travaillé en amont pour standardiser au maximum et mis
en place une ontologie afin de réunir tous les concepts nécessaires
pour décrire cet ensemble. Quel que soit l’objet de l’étude, celle-ci
sera conduite toujours avec les mêmes règles. Aujourd’hui, nos « IMGT
Colliers de Perles » ont été adoptés par toute la communauté
scientifique. Autrefois, la nomenclature était très hétérogène,
désormais, ce sont les noms des gènes d’immunoglobulines et de
récepteurs T définis par IMGT® qui sont approuvés et utilisés par les
laboratoires du monde entier. Gros atout d’IMGT® : le laboratoire est public et dépend du CNRS, ce qui permet une grande accessibilité du système : «
Tout est disponible sur le réseau, librement pour les chercheurs des
Universités et organismes publics et sous licence CNRS pour le secteur
privé », précise Marie-Paule Lefranc.
L’Equipe IMGT® montre que, dans la recherche publique, on peut
fonctionner à la manière d’une start-up : peu de réunions, mais
beaucoup de communication, une grande réactivité et une synergie que ne
dément pas la multiplication des contrats. |
Créé par le Professeur Marie-Paule Lefranc, IMGT® est
un système d’information complet pour les chercheurs. Il fournit un
accès commun à des données standardisées en matière de séquences
nucléotidiques, protéiques, de cartes de locus, de polymorphismes
génétiques et de structures 3D. IMGT® reçoit 140
000 requêtes chaque mois, 1/3 proviennent de l’Union européenne, 1/3
des états-Unis et du Canada, et le reste du monde entier. Le système
intéresse essentiellement quatre secteurs clés de la santé : la
recherche fondamentale (maladies infectieuses, vaccins…), la recherche
médicale (clinique, diagnostique), la recherche vétérinaire, les biotechnologies (ingénierie des anticorps), et enfin le monde industriel, en particulier pharmaceutique. « IMGT®, ce sont 6 bases de données standardisées, 15 outils en ligne et plus de 8 000 pages de ressources Web expertisées. » |
LABORATOIRE D'IMMUNOGENETIQUE
IMGT, LIGM, IGH, UPR CNRS 1142141, rue de la Cardonille
34396 Montpellier Cedex 5
Tél. : 04 99 61 99 65
Fax :
04 99 61 99 01
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