"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | Secondary accession numbers | Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ1 | IGHJ1*01 | F | G11 | L38965 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ2 | IGHJ2*01 | F | JIIR11 | L38966 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ3 | IGHJ3*01 | F | JIIR5 | L38967 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ4 | IGHJ4*01 | F | JIIRB5 | L38968 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ5 | IGHJ5*01 | (F) | + | + | M92851 | [2] | #c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ6 | IGHJ6*01 | (F) | + | + | IgM1gj | AF327520 | [3] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ7 | IGHJ7*01 | (F) | + | + | 3-4 | U18701 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ8 | IGHJ8*01 | (F) | + | + | 1.3 | U18680 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ9 | IGHJ9*01 | (F) | + | + | 5A | U18716 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ10 | IGHJ10*01 | (F) | + | + | 5Fs | U18717 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ11 | IGHJ11*01 | (F) | + | + | 1A | U18686 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ12 | IGHJ12*01 | (F) | + | + | 1C | U18687 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ13 | IGHJ13*01 | (F) | + | + | 4Fs | U18714 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ14 | IGHJ14*01 | (F) | + | + | 5H | U18718 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ15 | IGHJ15*01 | (F) | + | + | 4.-1 | U18713 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ16 | IGHJ16*01 | (F) | + | + | 3-10 | U18700 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ17 | IGHJ17*01 | (F) | + | + | 3-9 | U18702 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ18 | IGHJ18*01 | (F) | + | + | 4J | U18715 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ19 | IGHJ19*01 | (F) | + | + | 1N | U18726 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ20 | IGHJ20*01 | (F) | + | + | 2D | U18693 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ21 | IGHJ21*01 | (F) | + | + | 5D | U18725 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ22 | IGHJ22*01 | (F) | + | + | 12P | U18685 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ23 | IGHJ23*01 | (F) | + | + | 1I | U18688 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ24 | IGHJ24*01 | (F) | + | + | 9K | U18724 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ25 | IGHJ25*01 | (F) | + | + | 2K | U18696 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ26 | IGHJ26*01 | (F) | + | + | 3H1 | U18705 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ27 | IGHJ27*01 | (F) | + | + | 3G | U18703 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ28 | IGHJ28*01 | (F) | + | + | 12A | U18682 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ29 | IGHJ29*01 | (F) | + | + | 3L | U18706 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ30 | IGHJ30*01 | (F) | + | + | 3G1 | U18704 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ31 | IGHJ31*01 | (F) | + | + | 10N | U18681 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ32 | IGHJ32*01 | (F) | + | + | 12K | U18684 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ33 | IGHJ33*01 | (F) | + | + | 3N | U18708 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ34 | IGHJ34*01 | (F) | + | + | 7B | U18722 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ35 | IGHJ35*01 | (F) | + | + | 12J | U18683 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ36 | IGHJ36*01 | (F) | + | + | 1NDs | U18690 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ37 | IGHJ37*01 | (F) | + | + | 2H | U18695 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ38 | IGHJ38*01 | (F) | + | + | 3S | U18712 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ39 | IGHJ39*01 | (F) | + | + | 5NB | U18719 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ40 | IGHJ40*01 | (F) | + | + | 2A | U18691 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ41 | IGHJ41*01 | (F) | + | + | 2E | U18694 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ42 | IGHJ42*01 | (F) | + | + | 5NC | U18720 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ43 | IGHJ43*01 | (F) | + | + | 2P | U18698 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ44 | IGHJ44*01 | (F) | + | + | 2As | U18692 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ45 | (1) | IGHJ45*01 | (F) | + | + | 3M | U18707 | [1] | #c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ46 | IGHJ46*01 | (F) | + | + | 2T | U18699 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ47 | IGHJ47*01 | (F) | + | + | 3NG | U18710 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ48 | IGHJ48*01 | (F) | + | + | 1Is | U18689 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ49 | IGHJ49*01 | (F) | + | + | 3NB | U18709 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ50 | IGHJ50*01 | (F) | + | + | U51450 | [4] | #c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ51 | IGHJ51*01 | (F) | + | + | 2L | U18697 | [1] | #c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHJ52 | IGHJ52*01 | (F) | + | + | 9F | U18723 | [1] | #c |
#c: rearranged cDNA.