"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
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TRAJ1 | TRAJ1*01 | ORF | (1) | IMGT000020 | [1] | 83345..83434 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ2 | TRAJ2*01 | F | IMGT000020 | [1] | 82217..82310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ3 | TRAJ3*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 81671..81760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ4 | TRAJ4*01 | F | IMGT000020 | [1] | 80703..80793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ5 | TRAJ5*01 | F | IMGT000020 | [1] | 77972..78054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ6 | TRAJ6*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 76547..76636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ7 | TRAJ7*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 75888..75971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ8 | TRAJ8*01 | F | IMGT000020 | [1] | 73853..73940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ9 | TRAJ9*01 | F | IMGT000020 | [1] | 73250..73338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ10 | TRAJ10*01 | F | IMGT000020 | [1] | 71008..71100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ11 | TRAJ11*01 | F | IMGT000020 | [1] | 69981..70068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ12 | TRAJ12*01 | F | IMGT000020 | [1] | 69409..69496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ13 | TRAJ13*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 68223..>68300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ14 | TRAJ14*01 | ORF | (2) | IMGT000020 | [1] | 67493..67572 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ15 | TRAJ15*01 | F | IMGT000020 | [1] | 66800..66887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ16 | TRAJ16*01 | F | IMGT000020 | [1] | 65605..65693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ17 | TRAJ17*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 64187..64277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ18 | TRAJ18*01 | F | IMGT000020 | [1] | 62899..62992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ19 | TRAJ19*01 | ORF | (3) | IMGT000020 | [1] | 62516..62599 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ20 | TRAJ20*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 61547..61631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ21 | TRAJ21*01 | F | IMGT000020 | [1] | 60842..60922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ22 | TRAJ22*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 59320..59410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ23 | TRAJ23*01 | ORF | (4) | + | + | IMGT000020 | [1] | 57702..57792 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ24 | TRAJ24*01 | F | IMGT000020 | [1] | 57266..57356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ25 | TRAJ25*01 | ORF | (5) | + | + | IMGT000020 | [1] | 56191..56278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ26 | TRAJ26*01 | F | IMGT000020 | [1] | 55886..55973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ27 | TRAJ27*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 53277..53363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ28 | TRAJ28*01 | F | + | + | TRAJ29*01 | IMGT000020 | [1] | 52634..52727 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ29 | TRAJ29*01 | F | + | + | TRAJ30*01 | IMGT000020 | [1] | 51611..51698 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ30 | TRAJ30*01 | F | TRAJ31*01 | IMGT000020 | [1] | 50508..50597 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ31 | TRAJ31*01 | F | + | + | TRAJ32*01 | IMGT000020 | [1] | 48654..48738 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ32 | TRAJ32*01 | ORF | (6) | TRAJ33*01 | IMGT000020 | [1] | 47047..47143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ33 | TRAJ33*01 | F | + | + | TRAJ34*01 | IMGT000020 | [1] | 45977..46061 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ34 | TRAJ34*01 | F | + | + | TRAJ35*01 | IMGT000020 | [1] | 45121..45206 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ35 | TRAJ35*01 | ORF | (7) | TRAJ36*01 | IMGT000020 | [1] | 44072..44162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ36 | TRAJ36*01 | ORF | (8) | TRAJ37*01 | IMGT000020 | [1] | 42449..42537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ37 | TRAJ37*01 | F | + | + | TRAJ38*01 | IMGT000020 | [1] | 41725..41814 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ38 | TRAJ38*01 | F | TRAJ39*01 | IMGT000020 | [1] | 40235..40324 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ39 | TRAJ39*01 | F | (9) | TRAJ40*01 | IMGT000020 | [1] | 39592..39683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ40 | TRAJ40*01 | F | + | + | TRAJ41*01 | IMGT000020 | [1] | 37461..37545 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ41 | TRAJ41*01 | ORF | (10) | TRAJ42*01 | IMGT000020 | [1] | 35408..35491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ42 | TRAJ42*01 | F | TRAJ43*01 | IMGT000020 | [1] | 34892..34983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ43 | TRAJ43*01 | F | + | + | TRAJ44*01 | IMGT000020 | [1] | 34089..34173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ44 | TRAJ44*01 | F | TRAJ45*01 | IMGT000020 | [1] | 32996..33086 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ45 | TRAJ45*01 | ORF | (11) | TRAJ46*01 | IMGT000020 | [1] | 32132..32224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ46 | TRAJ46*01 | F | TRAJ47*01 | IMGT000020 | [1] | 31708..31798 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ47 | TRAJ47*01 | F | + | + | TRAJ48*01 | IMGT000020 | [1] | 31160..31244 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ48 | TRAJ48*01 | F | TRAJ49*01 | IMGT000020 | [1] | 29192..29279 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ49 | TRAJ49*01 | F | + | + | TRAJ50*01 | IMGT000020 | [1] | 28380..28466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ50 | TRAJ50*01 | F | TRAJ51*01 | IMGT000020 | [1] | 27500..27583 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ52 | TRAJ52*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 24901..25000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ53 | TRAJ53*01 | F | IMGT000020 | [1] | 21760..21853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ54 | TRAJ54*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 21086..21179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ55 | TRAJ55*01 | P | (12) | IMGT000020 | [1] | 20468..20551 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ56 | TRAJ56*01 | P | (12) | IMGT000020 | [1] | 17882..17970 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ57 | TRAJ57*01 | P | (13) | IMGT000020 | [1] | 17241..17330 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ58 | TRAJ58*01 | F | + | + | IMGT000020 | [1] | 16076..16166 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ59 | TRAJ59*01 | ORF | (14) | IMGT000020 | [1] | 14920..15007 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ60 | TRAJ60*01 | F | IMGT000020 | [1] | 14674..14758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ61 | TRAJ61*01 | ORF | (15) | IMGT000020 | [1] | 13657..13744 |