"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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Positions in contigs: limits from the first nucleotide of V-REGION to the last nucleotide.
IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Haplotypes | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (V-REGION) | Secondary accession numbers | Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (V-REGION) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1 | IGHV1S1 | IGHV1S1*01 | F | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | 2148-2434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S2 | IGHV1S2*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (1) | 9514-9799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S3 | IGHV1S3*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (2) | 19395-19691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S4 | IGHV1S4*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (3) | 35175-35448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S5 | IGHV1S5*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (4) | 47680-47974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S6 | IGHV1S6*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (4) | 52532-52820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S7 | IGHV1S7*01 | F | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | 61809-62101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S8 | IGHV1S8*01 | F | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | 74275-74567 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S9 | IGHV1S9*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (5) | 79156-79450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S10 | IGHV1S10*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (6) | 84811-85104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S11 | IGHV1S11*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (5) | 95728-96010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S12 | IGHV1S12*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (7) | 102237-102505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S13 | IGHV1S13*01 | F | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | 105318-1056 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S14 | IGHV1S14*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (8) | 107577-107770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S15 | IGHV1S15*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (5) | 118044-118335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S16 | IGHV1S16*01 | P | F-I | (24) | 38A2 | AY386694 | [1] | (4) | 125557-125850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S17 | IGHV1S17*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | 4344-4630 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S18 | IGHV1S18*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (9) | 9266-9560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S19 | IGHV1S19*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (10) | 15914-16134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S20 | IGHV1S20*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (11) | 22513-22793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S21 | IGHV1S21*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (12) | 32833-33119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S22 | IGHV1S22*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (13) | 37749-38043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S23 | IGHV1S23*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (10) | 44644-44864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S24 | IGHV1S24*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | 49458-49744 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S25 | IGHV1S25*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (14) | 56920-57206 | VH17-1-9 | U18652 | [2] | 241-527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S26 | IGHV1S26*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (15) | 63689-63978 | VH12-1-6 | U18651 | [2] | 241-530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S27 | IGHV1S27*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (16) | 71217-71508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S28 | IGHV1S28*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | 76272-76561 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S29 | IGHV1S29*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (17) | 79023-79309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S30 | IGHV1S30*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (18) | 83478-83769 | AF177017 | [3] | 241-532 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S31 | IGHV1S31*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | 88024-88313 | M93182 | [4] | 239-526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S32 | IGHV1S32*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (19) | 91243-91532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S33 | IGHV1S33*01 | P | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | (20) | 95940-96232 | 219D23 | AY386695 | [1] | 2829-3121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S34 | IGHV1S34*01 | F | F-I | (24) | 225P18 | AY386697 | [1] | 100974-1012 | 219D23 | AY386695 | [1] | 7863-8152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M93172 | [4] | 241-528 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S35 | IGHV1S35*01 | P | (25) | M12180 | [5] | (21) | 401-667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S36 | IGHV1S36*01 | F | (25) | M12180 | [5] | (22) | 3485-3771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S37 | IGHV1S37*01 | P | RVH701 | M60121 | [6] | (23) | 221-507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S39 | IGHV1S39*01 | F | M60336 | [7] | 87-373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S40 | IGHV1S40*01 | F | VH1-a3 | M93173 | [4] | 673-968 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S42 | IGHV1S42*01 | F | M93177 | [4] | 248-535 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S43 | IGHV1S43*01 | F | M93179 | [4] | 241-537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S44 | IGHV1S44*01 | F | M93181 | [4] | 241-525 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S45 | IGHV1S45*01 | F | M93183 | [4] | 241-539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S46 | IGHV1S46*01 | P | M93184 | [4] | 241-534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S47 | IGHV1S47*01 | F | M93185 | [4] | 241-534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S48 | IGHV1S48*01 | P | M93186 | [4] | (19) | 229-522 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S49 | IGHV1S49*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 1E6 | AF176997 | [3] | 378-665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S50 | IGHV1S50*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5084 | AF176998 | [3] | 378-665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S51 | IGHV1S51*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | sk5064 | AF176999 | [3] | 378-665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S52 | IGHV1S52*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | sk5074 | AF177000 | [3] | 378-665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S53 | IGHV1S53*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5332 | AF177001 | [3] | 378-668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S54 | IGHV1S54*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5312 | AF177002 | [3] | 355-645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S55 | IGHV1S55*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5252 | AF177003 | [3] | 355-645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S56 | IGHV1S56*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 9C4 | AF177004 | [3] | 378-668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S57 | IGHV1S57*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | sk5066 | AF177005 | [3] | 378-665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S58 | IGHV1S58*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | sk5086 | AF177006 | [3] | 377-667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S59 | IGHV1S59*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 1B3 | AF177007 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S60 | IGHV1S60*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 4A4 | AF177008 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S61 | IGHV1S61*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 6A1 | AF177009 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S62 | IGHV1S62*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 8E1 | AF177010 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S63 | IGHV1S63*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 10A2 | AF177011 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S64 | IGHV1S64*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 1C3 | AF177012 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S65 | IGHV1S65*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 4C4 | AF177013 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S66 | IGHV1S66*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | 1A6 | AF177014 | [3] | 377-664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S67 | IGHV1S67*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5314 | AF177015 | [3] | 354-641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S68 | IGHV1S68*01 | F | ali F-I | [8] | Alicia | SK5310 | AF177016 | [3] | 357-644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHV1S69 | IGHV1S69*01 | F | VH1-a1 | M93171 | [4] | 239-522 |