Citing IMGT dynamic tools: Sanou G., Zeitoun G. et al. IMGT® at scale: FAIR, Dynamic and Automated Tools for Immune Locus Analysis, Nucleic Acids Research. 2025;,gkaf1024. doi: 10.1093/nar/gkaf1024 (Free Article) PMID: 41091930.
Select a species and a locus:
Only IMGT available species/locus are shown in the drop-down list.

Human (Homo sapiens) TRA locus (on chromosome 14 at 14q11.2) gene repertoire per assembly:

Human (Homo sapiens) TRAV gene numbers per subgroup in IMGT annotated assemblies:

For each available species and locus, the evaluation of a locus gene repertoire is displayed in tables per gene type: V, D, J or C.
The first column on the left lists either IMGT subgroups for V genes, or IMGT sets or subgroups for D and J genes, or IMGT gene names for constant genes. Clicking on the link provides the lists of corresponding IMGT alleles per IMGT functionality.
Columns in «IMGT annotated assemblies» display for each IMGT annotated assembly the number of IMGT genes per functionality.
The two columns in «Number of genes» are shown only if there is more than one IMGT annotated assembly. These columns display the numbers of genes which are either «common to all IMGT annotated assemblies» or «Not common to all IMGT annotated assemblies».
The numbers of IMGT genes in the tables are provided per functionality (F for functional, O for ORF, P for pseudogene). If IMGT alleles for a given IMGT gene have different functionalities, these are concatenated (for example: 1 FOP).

Subgroup IMGT annotated assembliesNumber of genes
GRCh38.p14T2T_YAO_v2_patT2T_YAO_v2_matHG01123_mat_hprc_f2HG02257_mat_hprc_f2HG02109_pat_hprc_f2hg002v1.1.patCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAV12 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F0
TRAV21 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV31 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV41 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV51 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV61 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV71 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV85 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P5 F + 3 P0
TRAV92 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F0
TRAV101 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV112 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P0
TRAV123 F3 F3 F3 F3 F3 F3 F3 F0
TRAV132 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F0
TRAV141 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P0
TRAV151 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV161 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV171 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV181 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV191 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV201 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV211 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV221 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV231 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV241 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV251 F1 F1 F1 F1 P1 F1 F1 FP0
TRAV262 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F0
TRAV271 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV281 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV291 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV301 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV311 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV321 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV331 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV341 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV351 P1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 FP0
TRAV361 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV371 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAV382 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F2 F0
TRAV391 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV401 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV411 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAV461 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAVA1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAVB1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
TRAVC1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P0
Total number of IMGT genes44 F + 17 P
72%
28%
45 F + 16 P
74%
26%
45 F + 16 P
74%
26%
45 F + 16 P
74%
26%
44 F + 17 P
72%
28%
45 F + 16 P
74%
26%
45 F + 16 P
74%
26%
43 F + 2 FP + 16 P0
Human (Homo sapiens) TRAJ gene numbers per set or subgroup in IMGT annotated assemblies:
Set or subgroup IMGT annotated assembliesNumber of genes
GRCh38.p14T2T_YAO_v2_patT2T_YAO_v2_matHG01123_mat_hprc_f2HG02257_mat_hprc_f2HG02109_pat_hprc_f2hg002v1.1.patCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAJ11 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O0
TRAJ21 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O0
TRAJ31 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ41 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ51 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ61 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ71 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ81 P1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 FP0
TRAJ91 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ101 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ111 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ121 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ131 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ141 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ151 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ161 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ171 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ181 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ191 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O0
TRAJ201 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ211 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ221 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ231 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ241 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ251 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O1 O0
TRAJ261 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ271 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ281 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
TRAJ291 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ301 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ311 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ321 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ331 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ341 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ351 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ361 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ371 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ381 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ391 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ401 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ411 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ421 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ431 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ441 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ451 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ461 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ471 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ481 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ491 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ501 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ511 P1 P1 P1 P1 P1 P001 P
TRAJ521 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ531 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ541 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ551 P1 P1 P1 P1 P1 P001 P
TRAJ561 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ571 F1 F1 F1 F1 F1 F001 F
TRAJ581 O1 O1 O1 O1 O1 O001 O
TRAJ591 O1 O1 O1 O1 O1 O001 O
TRAJ601 P1 P1 P1 P1 P1 P001 P
TRAJ611 O1 O1 O1 O1 O1 O001 O
Total number of IMGT genes50 F + 7 O + 4 P
82%
11%
7%
51 F + 7 O + 3 P
84%
11%
5%
51 F + 7 O + 3 P
84%
11%
5%
51 F + 7 O + 3 P
84%
11%
5%
51 F + 7 O + 3 P
84%
11%
5%
51 F + 7 O + 3 P
84%
11%
5%
24 F + 4 O
86%
14%
23 F + 1 FP + 4 O27 F + 3 O + 3 P
Human (Homo sapiens) TRAC gene numbers per gene name in IMGT annotated assemblies:
Gene name IMGT annotated assembliesNumber of genes
GRCh38.p14T2T_YAO_v2_patT2T_YAO_v2_matHG01123_mat_hprc_f2HG02257_mat_hprc_f2HG02109_pat_hprc_f2hg002v1.1.patCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAC1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F1 F0
Total number of IMGT genes1 F
100%
1 F
100%
1 F
100%
1 F
100%
1 F
100%
1 F
100%
1 F
100%
1 F0
Human (Homo sapiens) TRA alleles per subgroup (set or gene name) and functionality in IMGT annotated assemblies:

The table displays IMGT alleles identified for Human (Homo sapiens) TRA locus per subgroup and functionality (F, O, P) in IMGT annotated assemblies.
Sign # indicates IMGT genes which are not common to all IMGT annotated assemblies.

Subgroup (set or gene name) GRCh38.p14 T2T_YAO_v2_pat T2T_YAO_v2_mat HG01123_mat_hprc_f2 HG02257_mat_hprc_f2 HG02109_pat_hprc_f2 hg002v1.1.pat
F O P F O P F O P F O P F O P F O P F O P
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