"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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Click on the strain name to get information on the strain (link to MGD).
The accession number AF037352 encompasses 105726 bp and includes the 5' part of the locus from TRGV7 to dowstream from TRGC3. AF021335 encompasses 62031 bp and includes the 3' part of the locus from TRGC2 to TRGC4. The mouse strain is not specified in these two accession numbers.
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Strain | Clone names | Exons | Accession numbers | Positions in the sequence | Secondary accession numbers | Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC1 | TRGC1*01 | F | 13 (10.0 cM) | BALB/c | Cgamma1 | EX1 | M13340 | [2] | Cgamma1 | AF037352 | [4] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2 | M13341 | [2] | Cgamma1 | AF037352 | [4] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX3 | M13342 | [2] | Cgamma1 | AF037352 | [4] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C57BL/6J | IMGT000133 | [6] | MAP | 46062-48574 | (4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC2 | TRGC2*01 | F | 13 (10.0 cM) | BALB/c | C10.5 | EX1 | M12834 | [1] | Cgamma2 | AF021335 | [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2 | M12835 | [1] | Cgamma2 | AF021335 | [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX3 | M12836 | [1] | Cgamma2 | AF021335 | [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C57BL/6J | IMGT000133 | [6] | MAP | complement(137022--139510) | (4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC3 | TRGC3*01 | ORF | (1) | 13 (10.0 cM) | BALB/c | C7.5 | EX1 | M12837 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2 | M12838 | [1] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX3 | M12839 | [1] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC3*02 | P | (2) | 13 (10.0 cM) | BALB/c | Cgamma3 | EX1 | AF037352 | [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2 | AF037352 | [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX3 | AF037352 | [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC3*03 | ORF | (1) | 13 (10.0 cM) | 92841-95356 | C57BL/6J | IMGT000133 | [6] | MAP | 92841-95356 | (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRGC4 | TRGC4*01 | F | (2) | 13 (10.0 cM) | BALB/c | Cgamma4 | EX1 | AF021335 | [5] | Cgamma4 | L02339 | [3] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2a | L02340 | [3] | Cgamma4 | AF021335 | [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX2b | L02341 | [3] | Cgamma4 | AF021335 | [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EX3 | AF021335 | [5] | C57BL/6J | IMGT000133 | [6] | MAP | 176517-184299 | (4) |