"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
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TRBJ1-1 | TRBJ1-1*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.1 | MAP | K02545 | [1] | 721..796 | Jbeta1.1 | MAP | M14158 | [3] | 721..796 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 640907..640982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 188584..188659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 555507..555582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-2 | TRBJ1-2*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.2 | MAP | K02545 | [1] | 858..933 | Jbeta1.2 | MAP | M14158 | [3] | 858..933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 641044..641119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 188721..188796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 555644..555719 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-3 | TRBJ1-3*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.3 | MAP | M14158 | [3] | 1471..1548 | Jbeta1.3 | MAP | L36092 | [5] | (3) | 641657..641734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 189334..189411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 556257..556334 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-4 | TRBJ1-4*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.4 | MAP | M14158 | [3] | 2067..2145 | Jbeta1.4 | MAP | L36092 | [5] | (3) | 642252..642330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 189929..190007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 556852..556930 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-5 | TRBJ1-5*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.5 | MAP | M14158 | [3] | 2340..2417 | Jbeta1.5 | MAP | L36092 | [5] | (3) | 642525..642602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 190202..190279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 557125..557202 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-6 | TRBJ1-6*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta1.6 | MAP | M14158 | [3] | 2831..2911 | CM000669.2 | IMGT000021 | 557615..557695 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ1-6*02 | F | 7q34 | Jbeta1.6 | MAP | L36092 | [5] | (3) | 643015..643095 | U66061 | [5] | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-1 | TRBJ2-1*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.1 | MAP | X02987 | [2] | 772..849 | Jbeta2.1 | MAP | M14159 | [3] | 1201..1278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M31346 | [4] | 24..101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 650392..650469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 564992..565069 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-2 | TRBJ2-2*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.2 | MAP | X02987 | [2] | 967..1045 | Jbeta2.2 | MAP | M14159 | [3] | 1396..1474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 650587..650665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 198264..198342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565187..565265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-2P | TRBJ2-2P*01 | ORF | (1) | 7q34 | Jbeta2P | MAP | X02987 | [2] | 1125..1177 | Jbeta2.2P | MAP | M14159 | [3] | 1561..1606 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 650752..650797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | 198429..198474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565324..565397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-3 | TRBJ2-3*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.3 | MAP | X02987 | [2] | 1254..1330 | Jbeta2.3 | MAP | M14159 | [3] | 1683..1759 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 650874..650950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | 198551..198627 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565474..565550 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-4 | TRBJ2-4*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.4 | MAP | X02987 | [2] | 1404..1481 | Jbeta2.4 | MAP | M14159 | [3] | 1834..1911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 651025..651102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 198702..198779 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565625..565702 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-5 | TRBJ2-5*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.5 | MAP | X02987 | [2] | 1525..1600 | Jbeta2.5 | MAP | M14159 | [3] | 1954..2028 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 651146..651221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 198823..198898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565746..565821 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-6 | TRBJ2-6*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.6 | MAP | X02987 | [2] | 1645..1725 | Jbeta2.6 | MAP | M14159 | [3] | 2071..2151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L36092 | [5] | (3) | 651266..651346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 565866..565946 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-7 | TRBJ2-7*01 | F | 7q34 | + | + | + | Jbeta2.7 | MAP | M14159 | [3] | 2288..2362 | Jbeta2.7 | MAP | L36092 | [5] | (3) | 651483..651557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
U66061 | [5] | (3) | 198943..199023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000669.2 | IMGT000021 | 566083..566157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRBJ2-7*02 | ORF | (2) | 7q34 | Jbeta2.7 | MAP | X02987 | [2] | 1862..1936 |
MAP: Mapped sequences.